معاونت پشتیبانی، بازوی اجرایی و ستون اصلی مدیریت منابع در پژوهشکده است که با هدف ارتقای بهره‌وری و تأمین زیرساخت‌های لازم برای فعالیت‌های پژوهشی تشکیل شده است. این معاونت با نظارت راهبردی بر دو مدیریت کلیدی «امور اداری» و «امور مالی»، وظیفه سازماندهی تشکیلات، مدیریت منابع انسانی و حفظ انضباط مالی را بر عهده دارد. تسهیل فرآیندهای اجرایی، تخصیص بهینه منابع و صیانت از دارایی‌های پژوهشکده از مهم‌ترین اهداف این واحد است. در نهایت، این معاونت می‌کوشد تا با فراهم‌سازی محیطی پویا و پاسخگو، زمینه را برای تمرکز حداکثری اعضای هیئت علمی و پژوهشگران بر مأموریت‌های علمی و توسعه‌ای فراهم آورد. .